У 1958 році наказом Міністерства вищої освіти УРСР № 904 санітарно-гігієнічний факультет Одеського медичного інституту був реорганізований в стоматологічний факультет.

До вересня 1960 були сформовані і почали функціонувати три спеціальні кафедри факультету: кафедра терапевтичної стоматології – завідувач к.м.н. А.І.Марченко, кафедра хірургічної стоматології – д.м.н. Г. І. Семенченко, кафедра ортопедичної стоматології яку очолив полковник медичної служби начальник окружної стоматологічної поліклініки В.І. Кулаженком.

Кафедра хірургічної стоматології була організована у вересні 1960 на базі клініки щелепно-лицевої хірургії Одеського науково-дослідного інституту стоматології і обласної клінічної стоматологічної поліклініки. Її керівником з 1960 по 1991 р був заслужений діяч науки і техніки України, професор Григорій Іванович Семенченко (1914-1996). Викладацький склад кафедри був сформований за рахунок практичних лікарів, клінічних ординаторів та аспірантів.
Під керівництвом професора Г.І.Семенченко почалася інтенсивна робота по засвоєнню професійних клінічних, оперативних і педагогічних навичок. З початку організації кафедри основним напрямком її науково-дослідної роботи є вивчення проблеми вроджених і набутих дефектів і деформацій щелепно-лицевої ділянки. Планомірне, послідовне і всебічне вивчення однієї з важливих і важких проблем відновної хірургії дозволило встановити ряд невідомих раніше порушень функціонального і органічного характеру не тільки в області дефекту, але і в ряді органів і систем у цій категорії хворих.

Отримані результати допомогли обґрунтувати ряд нових способів хірургічного лікування, оптимальні вікові терміни і послідовність їх проведення від народження до його повної медичної і соціальної реабілітації. Вирішення цих питань було відображено в цілому ряді дисертаційних робіт, виконаних співробітниками кафедри та аспірантами: кандидатська (1964) і докторська дисертація (1982) В.І.Вакуленко, кандидатська (1986) і докторська дисертація (2004) А.Г.Гулюка, кандидатські дисертації В.О.Лукьяненко (1964), Л.Я.Деребалюк (1966), Г.Г.Крикляса (1966), А.Ф.Коваленко (1967), А.Н.Левковіча (1967), Б. Я. Коломейчук (1968), І.С.Копіка (1969), Чан Гуй Хая (1982) і Нгуен Дінь Чана (1987) (В’єтнам), П.А.Лозенка (1988), Халіля Абдула Каріма (1989) (Сирія), Е.Д.Бабова (1992), А.М.Пасечнік (1998), Н.С.Олейнік (2003), В.Г.Крикляс а (2005), Г.О.Асмоловой (2007), Н.Б.Дмітріевой (2007).

Крім основної проблеми, колектив кафедри розробляв і інші актуальні питання хірургічної стоматології. Щодо вдосконалення діагностики та лікування запальних захворювань щелепно-лицевої ділянки виконані наступні дисертаційні роботи: І.К.Шіроковим (1966), М.Н.Марченко (1966), Б.Г.Голубом (1975), В.В.Мулькевічем (1981 ), Г. А.Жітковой (1983), Шейх Алі Хусейном (1989) (Сирія), новоутворень А.Н.Літвіненко (1965), В.А.Міронюк (1965), Самі Радван Хасаном (1972), В.І .Лунгу (2002), захворюванням слинних залоз: Л.Д.Чулаком (1983) і докторська дисертація А.Ф.Коваленко (1982), загального знеболювання в хірургічній стоматології Л.Т.Легейдой (1968), А.Г.Крівоплясом ( 1975), травматології щелепно-лицевої ділянки: О.О.Фаренюком (2003), О.О.Атанасовим (2004), Малеком Джафаром (Палестина) (2004), В.В.Парасочкіной (2004). Велику роль у формуванні кафедри хірургічної стоматології та інших стоматологічних кафедр ОНМедУ, ІС АМН України, а також інших медичних університетів зіграв науковий студентський гурток кафедри. З членів гуртка 7 стали докторами медичних наук, професорами, очолили кафедри ОНМедУ та інших університетів, близько 20 захистили кандидатські дисертації.

З 1960 до 1991 року кафедрою керував доктор мед.наук, професор Семенченко І. У 1949 році він захистив кандидатську дисертацію на тему: “Анкілози скронево-нижньощелепного суглоба і його лікування”, в 1958 році – докторську “остеомієліт нижньої щелепи в експерименті та клініці ». Після 1991 р, Кафедрою хірургічної стоматології керували учні професора Г.І.Семенченко: до 1998 доцент Г. Г. Крикляс (кандидатська дисертація на тему” Кісткова пластика альвеолярного відростка і пластика верхньої губи при вроджених незрощеннях обличчя” була захищена в 1966 році), а з 1998р. – д.м.н. професор А.Г.Гулюк (кандидатська дисертація на тему “Прогноз і профілактика ранніх післяопераційних ускладнень уранопластики”, захищена в 1986, докторська – “Патогенетичне обгрунтування методики поетапного хірургічного лікування дітей з вродженими незрощеннями верхньої губи і неба “, захищена в 2004 р.).
Під керівництвом проф. Г.І.Семенченко захищені співробітниками кафедри, аспірантами та здобувачами 9 докторських дисертацій і 56 кандидатських (з них 5 іноземними громадянами з Єгипту, В’єтнаму, Сирії). Під керівництвом проф. А.Г.Гулюка захищені співробітниками кафедри, аспірантів і здобувачів