Основні напрямки наукової діяльності кафедри:

  • Вивчення впливу факторів виробничого середовища на функціональний стан внутрішніх органів і кістково-м’язової системи, оптимізація методів діагностики, оцінка ефективності лікування і профілактики захворювань внутрішніх органів і кістково-м’язової  системи у працівників промислових та сільськогосподарських підприємств Півдня України.
  • Кафедра професійної патології, клінічної лабораторної та функціональної діагностики є засновником науково-педагогічної медичної школи “Фізіологія і патологія адаптації людини до умов Світового океану” (кафедра є опорною по підготовці фахівців з морської медицини).
  • Кафедра професійної патології, клінічної лабораторної та функціональної діагностики є одним з організаторів Всеукраїнської асоціації морської медицини, у рамках якої здійснює наукове керівництво профільними кафедрами і медичними комісіями з проведення медичних оглядів працівників флоту.
  • Екстремальна фізіологія кісткової системи. В рамках Української асоціації з проблем остеопорозу